Una de las especies más representativa es el buitre negro, tratándose la Sierra de Siruela de uno de los escasos enclaves donde nidifica la especie en toda la provincia. Otras especies de aves frecuentes en la zona son la cigüeña negra, alimoche, águila real, águila perdicera, búho real y chova pitirroja.
Los cantiles rocosos y la seguridad de la densa vegetación de las laderas, son la clave de la presencia de numerosas especies rupícolas amenazadas. El carácter forestal de la sierra, incluso con repoblaciones de pinar, favorece la presencia de otras rapaces como el azor o el gavilán. Las palomas torcaces en invierno, llegan a superar los 2000 ejemplares. En algunos dormideros de la sierra, ya en las dehesas cercanas, también existe un pequeño núcleo invernante de grullas.